Cari ragazzi,
come promesso ho abbinato ad ogni gruppo una proteina differente.
Allego qui il file excel comunque compilato anche nella versione cui accedete voi e istruzioni qui di seguito.
Ogni presentazione deve durare possibilmente non più di 12 minuti (3 minuti x 4 persone circa). Poi così lasciamo un po' di spazio alle domande.
Le analisi di ognuna di queste proteine dovranno contenere:
1. Analisi della sequenza mediante Protparam
2. Analisi della funzione o della reazione che eventualmente catalizzano, dei substrati noti per quell’enzima, della localizzazione cellulare, del ruolo della proteina se noto.
3. Se enzimi : Analisi ed identificazione del codice identificativo l’enzima e classe e sottoclasse…ect a cui appartiene, fornendo una giustificazione in base alla reazione catalizzata
4. Analisi strutturale: è disponibile una o più strutture descrittive sperimentali? È possibile ottenere un modello usando ad esempio Alphafold (trovate il link al modello già in Uniprot)? Descrivere il contenuto di struttura secondaria, terziaria quaternaria
5. Analisi mediante CATH server, indicando a che superfamiglia la struttura appartiene, e con che altri enzimi o proteine viene raggruppato oltre a che analogie si riscontrano etc..
6. E’ una proteina coinvolta in patologie note?
E’ una proteina ricombinante che viene utilizzata per applicazioni biomediche o biotecnologiche più in generale?
Potrebbe trovare utilizzo in futuro in uno di questi ambiti secondo voi?
Buon lavoro
laura